D’après le Code Rural, l’obligation d’entretenir les cours d’eau s’attache à la propriété du lit. Ce sont donc les riverains qui ont des obligations d’entretien de leur berge.
Il convient de maintenir la qualité et les fonctions écologiques de la végétation des berges par des interventions douces et sélectives. En effet, celle-ci offre tout un panel d’habitats pour la faune aquatique et terrestre et évite l’érosion excessive des berges et le réchauffement de l’eau en période estivale. Elle représente aussi une zone tampon aux flux de polluants et aux particules fines issus des versants.
Le Syndicat de la Seiche intervient de deux manières sur les berges : l’enlèvement sélectif des arbres tombés en travers du lit et la plantation.